Kitas jo garsus darbas – „Vitruvijaus žmogus“, sukurtas apie 1490 m., vaizduoja idealią žmogaus kūno proporciją pagal senovės Romos architekto Vitruvijaus mokymus.
Piešinys laikomas tobulo meno ir matematinės logikos sintezės pavyzdžiu. Vis dėlto daugiau nei penkis šimtmečius meno istorikai nesuprato, kodėl da Vinci pavaizdavo žmogaus rankas ir kojas būtent tokiomis proporcijomis.