Iki šiol šią Kauno šventovę aplenkdavo užsienio vargonininkai – groti kompiuteriniais vargonais jie atsisakydavo. Dabar, kai bažnyčioje pastatyti vamzdiniai vargonai, planuojama surengti daugiau koncertų: į spalį vyksiantį tarptautinį festivalį „Musica sacra“ jau pakviesti atlikėjai iš įvairių Europos šalių. Naujasis instrumentas yra dviejų manualų su pedaline klaviatūra, turi 21 registrą. Vargonuose skamba apie 1500 medinių ir metalo lydinio vamzdžių.
Vargonus sumontavę įmonės „Pflüger“ meistrai pabrėžė, kad šie vargonai turi išskirtinę akustiką. Vargonai įsigyti už Kauno miesto savivaldybės ir privačių rėmėjų lėšas.