Kaip skelbia „Lietuvos žinios“, 2006-aisiais įkurtą Juodkrantės jūrų kadetų mokyklą nuspręsta prijungti prie Nidos vidurinės mokyklos, po šios reorganizacijos čia mokysis tik 1-4 klasių mokinukai.
Pagrindinė kadetų mokyklos reorganizacijos priežastis ta, kad nei valstybė, nei Neringos merija, nei pati ugdymo įstaiga nuo jos veiklos pradžios taip ir nesugebėjo pasistatyti moksleivių bendrabučio.
Dienraščio duomenimis, nepaisant nesėkmės vakariniame Kuršių marių krante, jau kalbama apie naujos jūrų kadetų mokyklos steigimą rytiniame – Rusnėje.
Be įprastų pamokų, kadetų mokykloje moksleivių laukė speciali programa, susijusi su marinistika, jūreivyste, rytais būdavo iškilminga rikiuotė. Moksleiviai kadetų mokykloje mokėsi nuo 5 iki 10 klasės. Pirmaisiais metais jų buvo 20, 2007-aisiais -jau 50.